Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Xrcc4Q924T3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Xrcc4Q924T3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Xrcc4Q924T3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Xrcc4Q924T3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Xrcc4Q924T3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Xrcc4Q924T3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Xrcc4Q924T3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Xrcc4Q924T3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Xrcc4Q924T3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Xrcc4Q924T3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Xrcc4Q924T3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc4Q924T3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Xrcc4Q924T3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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