Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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