Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cabp4Q8VHC5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms