Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Smg8Q8VE18 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smg8Q8VE18 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smg8Q8VE18 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smg8Q8VE18 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smg8Q8VE18 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smg8Q8VE18 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smg8Q8VE18 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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