Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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