Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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