Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms