Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hecw1Q8K4P8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms