Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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