Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms