Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Prpf39Q8K2Z2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Prpf39Q8K2Z2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Prpf39Q8K2Z2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prpf39Q8K2Z2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms