Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Depp1Q8K2F3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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