Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr1eQ8K202 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms