Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkn3Q8K045 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms