Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf628Q8CJ78 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Znf628Q8CJ78 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Znf628Q8CJ78 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Znf628Q8CJ78 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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