Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rab11fip3Q8CHD8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rab11fip3Q8CHD8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rab11fip3Q8CHD8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rab11fip3Q8CHD8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip3Q8CHD8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rab11fip3Q8CHD8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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