Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm28Q8CGC6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms