Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hpf1Q8CFE2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hpf1Q8CFE2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hpf1Q8CFE2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hpf1Q8CFE2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms