Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms