Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms