Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms