Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp27Q8CEG8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp27Q8CEG8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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