Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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