Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Usp20Q8C6M1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Usp20Q8C6M1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Usp20Q8C6M1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp20Q8C6M1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp20Q8C6M1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp20Q8C6M1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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