Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms