Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21aQ8C0S4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ttc21aQ8C0S4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ttc21aQ8C0S4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ttc21aQ8C0S4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21aQ8C0S4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms