Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rapgef5Q8C0Q9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rapgef5Q8C0Q9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rapgef5Q8C0Q9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rapgef5Q8C0Q9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rapgef5Q8C0Q9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rapgef5Q8C0Q9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rapgef5Q8C0Q9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rapgef5Q8C0Q9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rapgef5Q8C0Q9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms