Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccser1Q8C0C4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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