Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp1Q8BJQ2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp1Q8BJQ2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp1Q8BJQ2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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