Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms