Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q8BGC1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms