Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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