Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M10.6Q85ZW5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms