Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.3 ms