Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Clec18aQ7TSQ1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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Clec18aQ7TSQ1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Clec18aQ7TSQ1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Clec18aQ7TSQ1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms