Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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