Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms