Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Actn1Q7TPR4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Actn1Q7TPR4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Actn1Q7TPR4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Actn1Q7TPR4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Actn1Q7TPR4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Actn1Q7TPR4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Actn1Q7TPR4 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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