Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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