Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b3Q6UQ17 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms