Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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