Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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