Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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