Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms