Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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AtrxQ61687 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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AtrxQ61687 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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AtrxQ61687 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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AtrxQ61687 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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AtrxQ61687 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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AtrxQ61687 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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AtrxQ61687 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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AtrxQ61687 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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AtrxQ61687 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtrxQ61687 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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