Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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BcanQ61361 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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BcanQ61361 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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BcanQ61361 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BcanQ61361 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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BcanQ61361 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BcanQ61361 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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BcanQ61361 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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BcanQ61361 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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BcanQ61361 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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BcanQ61361 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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BcanQ61361 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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BcanQ61361 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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BcanQ61361 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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BcanQ61361 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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BcanQ61361 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BcanQ61361 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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