Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms