Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Bod1Q5SQY2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 288.4 ms