Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rbm27Q5SFM8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm27Q5SFM8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms