Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms